Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NDUFA9Q16795 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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