Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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