Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ALX1Q15699 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALX1Q15699 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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