Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SURF1Q15526 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SURF1Q15526 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SURF1Q15526 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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