Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RYR3Q15413 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RYR3Q15413 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RYR3Q15413 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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