Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NKX1-1Q15270 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NKX1-1Q15270 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NKX1-1Q15270 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms