Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRRQ15256 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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PTPRRQ15256 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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PTPRRQ15256 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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PTPRRQ15256 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRRQ15256 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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PTPRRQ15256 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRRQ15256 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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