Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSME4Q14997 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSME4Q14997 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME4Q14997 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME4Q14997 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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