Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NBR1Q14596 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NBR1Q14596 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NBR1Q14596 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms