Protein–RNA interactions for Protein: Q14517

FAT1, Protocadherin Fat 1, humanhuman

Predictions only

Length 4,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT1Q14517 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAT1Q14517 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAT1Q14517 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms