Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCINQ13939 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCINQ13939 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCINQ13939 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCINQ13939 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCINQ13939 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCINQ13939 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCINQ13939 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCINQ13939 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCINQ13939 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCINQ13939 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCINQ13939 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCINQ13939 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCINQ13939 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCINQ13939 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCINQ13939 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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