Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKP1Q13835 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP1Q13835 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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