Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITGA7Q13683 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA7Q13683 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
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