Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA5AQ13591 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA5AQ13591 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA5AQ13591 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms