Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TARBP1Q13395 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TARBP1Q13395 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TARBP1Q13395 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TARBP1Q13395 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TARBP1Q13395 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TARBP1Q13395 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms