Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 COA2YPL189C-A 207 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 SYG1YIL047C 2709 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 APL6YGR261C 2430 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PUS1YPL212C 1635 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 TUP1YCR084C 2142 nt5.18□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 HAP1YLR256W 4509 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 GTR1YML121W 933 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YOL079WYOL079W 399 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YOR292CYOR292C 930 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 PRE2YPR103W 864 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 MRI1YPR118W 1236 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 CUE2YKL090W 1332 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 HXT4YHR092C 1731 nt5.17□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 CAB4YGR277C 918 nt5.16□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.16□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 BIT2YBR270C 1638 nt5.15□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 UGA1YGR019W 1416 nt5.15□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 SER33YIL074C 1410 nt5.15□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 DRN1YGR093W 1524 nt5.15□□□□□ -1.58
VPS54Q12071 RML2YEL050C 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 THI5YFL058W 1023 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YGL185CYGL185C 1140 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 PEX22YAL055W 543 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YLR346CYLR346C 306 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 CSR1YLR380W 1227 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 THI12YNL332W 1023 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 HES1YOR237W 1305 nt5.15□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SLT2YHR030C 1455 nt5.14□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MCM4YPR019W 2802 nt5.14□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ARO2YGL148W 1131 nt5.14□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YNG2YHR090C 849 nt5.14□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 APM1YPL259C 1428 nt5.14□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 NOP8YOL144W 1455 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SUM1YDR310C 3189 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 GIP2YER054C 1647 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 JAC1YGL018C 555 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MRS3YJL133W 945 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ATG33YLR356W 594 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MRPL4YLR439W 960 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YNL296WYNL296W 315 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 CUE5YOR042W 1236 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ETT1YOR051C 1239 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 IML2YJL082W 2196 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 PXA1YPL147W 2613 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ELP2YGR200C 2367 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 UBA2YDR390C 1911 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 BRE2YLR015W 1518 nt5.13□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SEC39YLR440C 2130 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ADE3YGR204W 2841 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ATH1YPR026W 3636 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MBP1YDL056W 2502 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ARP10YDR106W 855 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 GRX4YER174C 735 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 AAD6YFL056C 639 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YJR085CYJR085C 318 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ECM1YAL059W 639 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ECM15YBL001C 315 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YNR042WYNR042W 429 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YPL113CYPL113C 1191 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 VHS2YIL135C 1311 nt5.12□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 ARN1YHL040C 1884 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 DAL81YIR023W 2913 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 CTR3YLR411W 726 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MDG1YNL173C 1101 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 FEX1YOR390W 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 FEX2YPL279C 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 UGA2YBR006W 1494 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SIS2YKR072C 1689 nt5.11□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SNM1YDR478W 597 nt5.1□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 VPS29YHR012W 849 nt5.1□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MMT2YPL224C 1455 nt5.1□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SAP155YFR040W 3009 nt5.1□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 IMA1YGR287C 1770 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YAP1802YGR241C 1707 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 MUM3YOR298W 1440 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 PHO90YJL198W 2646 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YGR122WYGR122W 1209 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 SPS18YNL204C 903 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 YPL014WYPL014W 1146 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 UBP7YIL156W 3216 nt5.09□□□□□ -1.59
VPS54Q12071 HXT14YNL318C 1623 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SDA1YGR245C 2304 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 PCL8YPL219W 1479 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 TRS23YDR246W 660 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YMR010WYMR010W 1218 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 NOP13YNL175C 1212 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 HPC2YBR215W 1878 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 CDC4YFL009W 2340 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 PSE1YMR308C 3270 nt5.08□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 MAD3YJL013C 1548 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 APM2YHL019C 1818 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 UBP9YER098W 2265 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 YEL028WYEL028W 462 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SKI8YGL213C 1194 nt5.07□□□□□ -1.6
VPS54Q12071 SPO12YHR152W 522 nt5.07□□□□□ -1.6
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