Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 GPT2YKR067W 2232 nt5.71□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 NSI1YDR026C 1713 nt5.71□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 LSG1YGL099W 1923 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 ULA1YPL003W 1389 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CHO1YER026C 831 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 PRP45YAL032C 1140 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 SSK1YLR006C 2139 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YMR010WYMR010W 1218 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YIM2YMR151W 438 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 PFA3YNL326C 1011 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 DSC2YOL073C 969 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 MRP51YPL118W 1035 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CRZ1YNL027W 2037 nt5.7□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YIL060WYIL060W 435 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YLR326WYLR326W 723 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CTL1YMR180C 963 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YNL296WYNL296W 315 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 GPM3YOL056W 912 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 NRG2YBR066C 663 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YPR015CYPR015C 744 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 VTH1YIL173W 4650 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 VTH2YJL222W 4650 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CUS1YMR240C 1311 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 ACF2YLR144C 2340 nt5.69□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CLA4YNL298W 2529 nt5.68□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YDR222WYDR222W 1248 nt5.68□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 TRP4YDR354W 1143 nt5.68□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 MRPS8YMR158W 468 nt5.68□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 STE13YOR219C 2796 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 GCR2YNL199C 1605 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 GAS2YLR343W 1668 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 IBA57YJR122W 1494 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YDL026WYDL026W 312 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 IRC6YFR043C 714 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YNL019CYNL019C 855 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YNL033WYNL033W 855 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 ROX3YBL093C 663 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 MET16YPR167C 786 nt5.67□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 HFI1YPL254W 1467 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 CBP1YJL209W 1965 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YCR099CYCR099C 468 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YDR282CYDR282C 1245 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 OKP1YGR179C 1221 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 BAG7YOR134W 1230 nt5.66□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 UBP9YER098W 2265 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 YIL067CYIL067C 2037 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 GEX1YCL073C 1848 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 ALD6YPL061W 1503 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 SIP2YGL208W 1248 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 MPM1YJL066C 759 nt5.65□□□□□ -1.5
HFI1Q12060 HRP1YOL123W 1605 nt5.65□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 MLF3YNL074C 1359 nt5.65□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 NOP2YNL061W 1857 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RSM10YDR041W 612 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YFT2YDR319C 825 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YDR336WYDR336W 945 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 TIM21YGR033C 720 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 GEP5YLR091W 882 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 SPO20YMR017W 1194 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RPS19BYNL302C 435 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 VPS68YOL129W 555 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 SER1YOR184W 1188 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 SSK22YCR073C 3996 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 MPP10YJR002W 1782 nt5.64□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PRR2YDL214C 2100 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YDR134CYDR134C 411 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RPL12AYEL054C 498 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PAU17YLL025W 375 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 BUD28YLR062C 378 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PRM9YAR031W 897 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PRE7YBL041W 726 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YNL134CYNL134C 1131 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 snR3snR3 194 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 UBP7YIL156W 3216 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 IFM1YOL023W 2031 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RAD7YJR052W 1698 nt5.63□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 UTR4YEL038W 684 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YPT32YGL210W 669 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YKR047WYKR047W 306 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YOL166CYOL166C 339 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 COT1YOR316C 1320 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RAD57YDR004W 1383 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 GIP1YBR045C 1920 nt5.62□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.61□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 TIP20YGL145W 2106 nt5.61□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YLL047WYLL047W 384 nt5.61□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PGA2YNL149C 390 nt5.61□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.61□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 NOT3YIL038C 2511 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YKL107WYKL107W 930 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 SPS18YNL204C 903 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 RRT2YBR246W 1164 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PEX34YCL056C 435 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 BZZ1YHR114W 1902 nt5.6□□□□□ -1.51
HFI1Q12060 PMA1YGL008C 2757 nt5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms