Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms