Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE4DQ08499 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms