Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 EMC4YGL231C 573 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 IME1YJR094C 1083 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 YJR107WYJR107W 987 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 GSP1YLR293C 660 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 CDC73YLR418C 1182 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 GPI12YMR281W 915 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 RRG9YNL213C 645 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 YOR111WYOR111W 699 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 GAL7YBR018C 1101 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 UGO1YDR470C 1509 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 CYB2YML054C 1776 nt6.84□□□□□ -1.31
HDA3Q06623 SAG1YJR004C 1953 nt6.84□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 IML2YJL082W 2196 nt6.84□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 BNA5YLR231C 1362 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SEC23YPR181C 2307 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 GUP2YPL189W 1830 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YIL001WYIL001W 1542 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 ZWF1YNL241C 1518 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MTC7YEL033W 420 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 NTG1YAL015C 1200 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MRPL13YKR006C 795 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YMR085WYMR085W 1299 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 AIM36YMR157C 768 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YOR238WYOR238W 912 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YPL199CYPL199C 723 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YEH1YLL012W 1722 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SMC5YOL034W 3282 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 UTP7YER082C 1665 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 PUT1YLR142W 1431 nt6.83□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MGA1YGR249W 1371 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 EFM1YHL039W 1758 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 PST1YDR055W 1335 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 TUF1YOR187W 1314 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RNY1YPL123C 1305 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YMR1YJR110W 2067 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YBR241CYBR241C 1467 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SCM3YDL139C 672 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 OCA6YDR067C 675 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YIM1YMR152W 1098 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MDJ2YNL328C 441 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YOL099CYOL099C 492 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SER1YOR184W 1188 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YOR338WYOR338W 1092 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YBR071WYBR071W 636 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 BCS1YDR375C 1371 nt6.82□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YMR034CYMR034C 1305 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 EDC3YEL015W 1656 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 NAF1YNL124W 1479 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 GSH2YOL049W 1476 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 snR7-LsnR7-L 214 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 DOS2YDR068W 933 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RRP8YDR083W 1179 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 CIA1YDR267C 993 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 URA3YEL021W 804 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YJR157WYJR157W 363 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YOR114WYOR114W 885 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 CAR1YPL111W 1002 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YBR116CYBR116C 528 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 snR30snR30 606 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 HBN1YCL026C-B 582 nt6.81□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 TAH11YJR046W 1815 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 REF2YDR195W 1602 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 CCT3YJL014W 1605 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 FET3YMR058W 1911 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 COS4YFL062W 1140 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RTA1YGR213C 954 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YHR095WYHR095W 495 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RPI1YIL119C 1224 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MID2YLR332W 1131 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SAS2YMR127C 1017 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YNL013CYNL013C 378 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 PLP2YOR281C 861 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YPR012WYPR012W 255 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YJR061WYJR061W 2808 nt6.8□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YEN1YER041W 2280 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RVS161YCR009C 798 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 CIA2YHR122W 696 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YIL152WYIL152W 708 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YLR374CYLR374C 390 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RPN13YLR421C 471 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YMR084WYMR084W 789 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YBL094CYBL094C 333 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 CST26YBR042C 1194 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 TRS20YBR254C 528 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YCL007CYCL007C 393 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YCL049CYCL049C 939 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 GSH1YJL101C 2037 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 URA7YBL039C 1740 nt6.79□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 MTH1YDR277C 1302 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 LCB2YDR062W 1686 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 LSM4YER112W 564 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 NQM1YGR043C 1002 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 BUD32YGR262C 786 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RPL2BYIL018W 765 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 SDS3YIL084C 984 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt6.78□□□□□ -1.32
HDA3Q06623 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.7 ms