Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNP2Q05952 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNP2Q05952 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms