Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 ISR1YPR106W 1332 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YCL065WYCL065W 369 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 NVJ1YHR195W 966 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 XPT1YJR133W 630 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YOR024WYOR024W 324 nt5.29□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 RFT1YBL020W 1725 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 ARN1YHL040C 1884 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 VHS2YIL135C 1311 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 UTP7YER082C 1665 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YFL034WYFL034W 3222 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 HRP1YOL123W 1605 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YDL183CYDL183C 963 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YRA1YDR381W 681 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 GRX4YER174C 735 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 MOB2YFL034C-B 864 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 VMA16YHR026W 642 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SPO7YAL009W 780 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YJR085CYJR085C 318 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 YLR124WYLR124W 345 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 PRM9YAR031W 897 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 RPS31YLR167W 459 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 NCE103YNL036W 666 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 TMN2YDR107C 2019 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 ADE3YGR204W 2841 nt5.28□□□□□ -1.56
YKU80Q04437 SAS10YDL153C 1833 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MGS1YNL218W 1764 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 CLF1YLR117C 2064 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 AAD4YDL243C 990 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ESF1YDR365C 1887 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YLR036CYLR036C 612 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 CTR3YLR411W 726 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PEX12YMR026C 1200 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YPL073CYPL073C 486 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 UIP4YPL186C 915 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 CKS1YBR135W 453 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YJL206CYJL206C 2277 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MPH2YDL247W 1830 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ARG4YHR018C 1392 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MPC54YOR177C 1395 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 TRK2YKR050W 2670 nt5.27□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 THI22YPR121W 1719 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MRT4YKL009W 711 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PSR1YLL010C 1284 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SNO1YMR095C 675 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 TSL1YML100W 3297 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 HXT4YHR092C 1731 nt5.26□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SEC9YGR009C 1956 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 UTP6YDR449C 1323 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PRM7YDL039C 2097 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 QDR1YIL120W 1692 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PUF3YLL013C 2640 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 AUA1YFL010W-A 285 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 DSD1YGL196W 1287 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YGR273CYGR273C 525 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 LEM3YNL323W 1245 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YOL050CYOL050C 321 nt5.25□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 EKI1YDR147W 1605 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PXA1YPL147W 2613 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ERV14YGL054C 417 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SPC24YMR117C 642 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 OAZ1YPL052W 879 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MKS1YNL076W 1755 nt5.24□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 TFC7YOR110W 1308 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PUS1YPL212C 1635 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PEX19YDL065C 1029 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 RPL28YGL103W 450 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PAN6YIL145C 930 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 RPA49YNL248C 1248 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SHM1YBR263W 1473 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 GAS2YLR343W 1668 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 KCC4YCL024W 3114 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ERG4YGL012W 1422 nt5.23□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YGR125WYGR125W 3111 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MIF2YKL089W 1650 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 UBC1YDR177W 648 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 MHO1YJR008W 1017 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YAR061WYAR061W 204 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 PGA3YML125C 939 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SNO4YMR322C 714 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ISU2YOR226C 471 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 HSP33YOR391C 714 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 snR17bsnR17b 332 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 HSP32YPL280W 714 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 ANT1YPR128C 987 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YPR195CYPR195C 330 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 snR34snR34 203 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 AXL2YIL140W 2472 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 SIF2YBR103W 1608 nt5.22□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 RIM15YFL033C 5313 nt5.21□□□□□ -1.57
YKU80Q04437 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 LSM6YDR378C 261 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 HPM1YIL110W 1134 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 SEN34YAR008W 828 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 SHP1YBL058W 1272 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 MFA2YNL145W 117 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 NAT3YPR131C 588 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 HST1YOL068C 1512 nt5.21□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 AIM10YER087W 1731 nt5.2□□□□□ -1.58
YKU80Q04437 MHF2YDL160C-A 243 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.2 ms