Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YEL045CYEL045C 426 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YJU2YKL095W 837 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 YAR061WYAR061W 204 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 ECM7YLR443W 1347 nt3.84□□□□□ -1.79
YHP1Q04116 EUG1YDR518W 1554 nt3.84□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 DBF2YGR092W 1719 nt3.84□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RTC5YOR118W 1704 nt3.84□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SSB2YNL209W 1842 nt3.84□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 HOF1YMR032W 2010 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 TAF5YBR198C 2397 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 FAP1YNL023C 2898 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 VPS29YHR012W 849 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 PUS5YLR165C 765 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 HLJ1YMR161W 675 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YNL296WYNL296W 315 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 MAK3YPR051W 531 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 AIM17YHL021C 1398 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 HRR25YPL204W 1485 nt3.83□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 HXT7YDR342C 1713 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 HXT6YDR343C 1713 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 DRN1YGR093W 1524 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 FUM1YPL262W 1467 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SER33YIL074C 1410 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 KDX1YKL161C 1302 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 NOP16YER002W 696 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YFR035CYFR035C 345 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 DCD1YHR144C 939 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 PEX22YAL055W 543 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 GRE1YPL223C 507 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SEG2YKL105C 3399 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 DOA1YKL213C 2148 nt3.82□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 FHL1YPR104C 2811 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RRP3YHR065C 1506 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RRB1YMR131C 1536 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SDA1YGR245C 2304 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 VHS2YIL135C 1311 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SRG1SRG1 551 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 JAC1YGL018C 555 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 NPY1YGL067W 1155 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 COG1YGL223C 1254 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 ZRT1YGL255W 1131 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 PCT1YGR202C 1275 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 TEF4YKL081W 1239 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YNR042WYNR042W 429 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YPL199CYPL199C 723 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 ARN1YHL040C 1884 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RCK2YLR248W 1833 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 MPP10YJR002W 1782 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YAP1802YGR241C 1707 nt3.81□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 FAA3YIL009W 2085 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RAD30YDR419W 1899 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 ORM1YGR038W 669 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YMR010WYMR010W 1218 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YIM1YMR152W 1098 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 NPT1YOR209C 1290 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YPR109WYPR109W 885 nt3.8□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 PUT1YLR142W 1431 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 KAP114YGL241W 3015 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 COT1YOR316C 1320 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SFI1YLL003W 2841 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 APL6YGR261C 2430 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 IPK1YDR315C 846 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SCS2YER120W 735 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YNG2YHR090C 849 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SLZ1YNL196C 897 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 SIF2YBR103W 1608 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 RAD28YDR030C 1521 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 NOP8YOL144W 1455 nt3.79□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 MSC7YHR039C 1935 nt3.78□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 GIP2YER054C 1647 nt3.78□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt3.78□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 ATG33YLR356W 594 nt3.78□□□□□ -1.8
YHP1Q04116 PDR15YDR406W 4590 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 CAB4YGR277C 918 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 FEX1YOR390W 1128 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 FEX2YPL279C 1128 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 NUP116YMR047C 3342 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YMR196WYMR196W 3267 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 PRP43YGL120C 2304 nt3.77□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MLF3YNL074C 1359 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 APC4YDR118W 1959 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 PAP1YKR002W 1707 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 GPR1YDL035C 2886 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YEF1YEL041W 1488 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 LUC7YDL087C 786 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 CPR6YLR216C 1116 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YNL165WYNL165W 1221 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YTH1YPR107C 627 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 ARC40YBR234C 1155 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YGR125WYGR125W 3111 nt3.76□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 TUB3YML124C 1338 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 ASK10YGR097W 3441 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 HNT2YDR305C 654 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MNN11YJL183W 1269 nt3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73 ms