Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	YJR124C	YJR124C	1347 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	CLP1	YOR250C	1338 nt		5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	SPR6	YER115C	576 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	BNA6	YFR047C	888 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YBL010C	YBL010C	843 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	PHA2	YNL316C	1005 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	YMD8	YML038C	1329 nt		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.71	□□□□□ -1.49
SYF1	Q04048	DIT1	YDR403W	1611 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RIM101	YHL027W	1878 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PML1	YLR016C	615 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	MAC1	YMR021C	1254 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	TOM40	YMR203W	1164 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RGS2	YOR107W	930 nt		5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	VAN1	YML115C	1608 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GCR2	YNL199C	1605 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	STE12	YHR084W	2067 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ALD3	YMR169C	1521 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ALD2	YMR170C	1521 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YJL107C	YJL107C	1164 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	POR1	YNL055C	852 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	CWC25	YNL245C	540 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PUT1	YLR142W	1431 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	MRE11	YMR224C	2079 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ADE3	YGR204W	2841 nt		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	FAP1	YNL023C	2898 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	CTS1	YLR286C	1689 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RSM10	YDR041W	612 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YAR023C	YAR023C	540 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YIL092W	YIL092W	1902 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	MKS1	YNL076W	1755 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GPI18	YBR004C	1302 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	XPT1	YJR133W	630 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ALG5	YPL227C	1005 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	LAP2	YNL045W	2016 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ARH1	YDR376W	1482 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GWT1	YJL091C	1473 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RET1	YOR207C	3450 nt		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	MRF1	YGL143C	1242 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YOL035C	YOL035C	303 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ATG14	YBR128C	1035 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.67	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YDR133C	YDR133C	336 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PHO86	YJL117W	936 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	NMA1	YLR328W	1206 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GTR1	YML121W	933 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	RPC19	YNL113W	429 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	AIF1	YNR074C	1137 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	YOR292C	YOR292C	930 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ECM23	YPL021W	564 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	GDT1	YBR187W	843 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	PUS1	YPL212C	1635 nt		5.66	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	URA3	YEL021W	804 nt		5.65	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	SPC42	YKL042W	1092 nt		5.65	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.65	□□□□□ -1.5
SYF1	Q04048	ASA1	YPR085C	1332 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	PDR10	YOR328W	4695 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	MAG2	YLR427W	2013 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	HOS2	YGL194C	1359 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	DBF4	YDR052C	2115 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	CLA4	YNL298W	2529 nt		5.65	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	ARB1	YER036C	1833 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	ATG1	YGL180W	2694 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	AIR2	YDL175C	1035 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	MRPL25	YGR076C	474 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	RHO3	YIL118W	696 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YMR147W	YMR147W	672 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	MRPL24	YMR193W	777 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	ZPS1	YOL154W	750 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YPL245W	YPL245W	1365 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YDR132C	YDR132C	1488 nt		5.64	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	IML2	YJL082W	2196 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	DAK1	YML070W	1755 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	HIR2	YOR038C	2628 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	RRP3	YHR065C	1506 nt		5.63	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	WHI4	YDL224C	1950 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	ENV9	YOR246C	993 nt		5.62	□□□□□ -1.51
SYF1	Q04048	CEG1	YGL130W	1380 nt		5.62	□□□□□ -1.51

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