Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFAIP2Q03169 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP2Q03169 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms