Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITX1P78337 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITX1P78337 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITX1P78337 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITX1P78337 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITX1P78337 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX1P78337 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX1P78337 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX1P78337 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX1P78337 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITX1P78337 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITX1P78337 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITX1P78337 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PITX1P78337 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITX1P78337 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITX1P78337 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITX1P78337 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms