Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6P62753 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6P62753 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6P62753 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6P62753 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6P62753 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6P62753 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6P62753 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6P62753 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6P62753 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPS6P62753 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPS6P62753 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6P62753 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6P62753 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6P62753 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6P62753 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6P62753 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6P62753 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6P62753 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6P62753 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms