Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPI1P60174 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPI1P60174 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPI1P60174 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPI1P60174 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPI1P60174 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPI1P60174 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPI1P60174 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPI1P60174 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPI1P60174 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPI1P60174 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPI1P60174 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPI1P60174 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPI1P60174 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms