Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA9P57773 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA9P57773 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA9P57773 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA9P57773 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA9P57773 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA9P57773 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA9P57773 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GJA9P57773 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GJA9P57773 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GJA9P57773 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJA9P57773 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA9P57773 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA9P57773 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA9P57773 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA9P57773 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJA9P57773 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJA9P57773 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms