Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BACE1P56817 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BACE1P56817 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BACE1P56817 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BACE1P56817 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BACE1P56817 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BACE1P56817 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BACE1P56817 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BACE1P56817 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BACE1P56817 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BACE1P56817 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BACE1P56817 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BACE1P56817 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BACE1P56817 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BACE1P56817 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BACE1P56817 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BACE1P56817 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms