Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARFIP1P53367 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARFIP1P53367 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms