Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC25A1P53007 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A1P53007 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A1P53007 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A1P53007 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A1P53007 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms