Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST1P52848 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST1P52848 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST1P52848 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST1P52848 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST1P52848 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST1P52848 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST1P52848 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST1P52848 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST1P52848 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST1P52848 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST1P52848 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST1P52848 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST1P52848 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST1P52848 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST1P52848 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST1P52848 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST1P52848 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST1P52848 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST1P52848 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST1P52848 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NDST1P52848 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST1P52848 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms