Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF135P52742 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF135P52742 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms