Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA2P51587 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRCA2P51587 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRCA2P51587 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRCA2P51587 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms