Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBP50607 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBP50607 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBP50607 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBP50607 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBP50607 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBP50607 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBP50607 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBP50607 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBP50607 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBP50607 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms