Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSEN2P49810 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSEN2P49810 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSEN2P49810 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms