Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK1EP49674 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK1EP49674 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1EP49674 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms