Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX9P48436 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX9P48436 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX9P48436 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX9P48436 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX9P48436 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX9P48436 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX9P48436 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX9P48436 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX9P48436 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX9P48436 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX9P48436 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX9P48436 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX9P48436 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX9P48436 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX9P48436 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOX9P48436 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX9P48436 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX9P48436 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX9P48436 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms