Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD4P46934 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4P46934 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms