Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPL28P46779 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPL28P46779 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPL28P46779 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPL28P46779 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL28P46779 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL28P46779 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPL28P46779 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RPL28P46779 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPL28P46779 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPL28P46779 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPL28P46779 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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