Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3CBP42338 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CBP42338 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIK3CBP42338 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms