Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBL1P41271 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBL1P41271 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBL1P41271 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBL1P41271 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBL1P41271 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBL1P41271 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBL1P41271 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBL1P41271 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBL1P41271 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBL1P41271 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBL1P41271 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBL1P41271 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBL1P41271 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBL1P41271 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms