Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTRLP40313 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTRLP40313 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTRLP40313 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTRLP40313 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTRLP40313 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTRLP40313 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTRLP40313 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms