Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THPOP40225 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THPOP40225 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THPOP40225 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THPOP40225 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THPOP40225 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THPOP40225 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THPOP40225 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
THPOP40225 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THPOP40225 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
THPOP40225 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
THPOP40225 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
THPOP40225 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THPOP40225 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THPOP40225 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THPOP40225 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THPOP40225 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
THPOP40225 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THPOP40225 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THPOP40225 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THPOP40225 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THPOP40225 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THPOP40225 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms