Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL4P36578 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL4P36578 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL4P36578 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL4P36578 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL4P36578 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL4P36578 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL4P36578 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms