Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA4P35212 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA4P35212 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA4P35212 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA4P35212 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA4P35212 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA4P35212 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA4P35212 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA4P35212 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA4P35212 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA4P35212 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA4P35212 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA4P35212 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA4P35212 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA4P35212 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJA4P35212 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJA4P35212 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJA4P35212 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms