Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCKARP32238 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCKARP32238 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCKARP32238 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCKARP32238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCKARP32238 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCKARP32238 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCKARP32238 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCKARP32238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCKARP32238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms