Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCD3P28288 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCD3P28288 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms