Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1BP28222 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms