Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKBIAP25963 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKBIAP25963 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms